Là một đơn vị nghiên cứu - triển khai, Viện luôn chú trọng công tác đào tạo cán bộ chuyên môn, nghiệp vụ nhằm nâng cao chất lượng và hiệu quả công việc. Trong giai đoạn 2007-2011, Viện đã cử cán bộ của mình đi đào tạo tại các cơ sở đào tạo trong và ngoài nước gồm 17 tiến sĩ và 22 thạc sĩ.

Trong khuôn khổ hợp tác đào tạo, năm 2008 Viện đã cử 02 cán bộ đi làm nghiên cứu sinh bằng học bổng của đối tác tại Viện công nghệ Hóa học Hàn Quốc (KRICT). Năm 2009, Viện cử đi đào tạo 01 thạc sĩ và 02 tiến sĩ tại trường Đại học Hankyon và 01 NCS tại Pháp. Năm 2010, Viện cử 01 cán bộ làm luận văn thạc sĩ tại Pháp, 01 NCS thi đỗ học bổng của Bộ Giáo dục – Đào tạo và học bổng của Đức.

Viện cũng có chức năng đào tạo tiến sĩ chuyên ngành Hóa hữu cơ và chuyên ngành Hóa lý. Trong 5 năm qua, Viện đã tổ chức đào tạo được 2 tiến sĩ và đang đào tạo 11 nghiên cứu sinh thuộc hai lĩnh vực chuyên ngành trên. Ngoài ra, Viện còn tổ chức được một số lớp đào tạo, tập huấn cho cán bộ công nhân viên.